Если опираться строго на текст налогового кодекса, в котором нет отдельной нормы, касающейся ставки налога для граждан ЕАЭС, тогда получается, что с начала года налог будет по ставке 30%, а после обретения работником статуса налогового резидента НДФЛ нужно пересчитать по ставке 13%.
Прямых разъяснений именно для такой ситуации я не нашла, но было следующее:
Цитата: Статьей 73 Договора о Евразийском экономическом союзе от 29 мая 2014 года предусмотрено, что в случае, если одно государство - член Евразийского экономического союза в соответствии с его законодательством и положениями международных договоров вправе облагать налогом доход налогового резидента (лица с постоянным местопребыванием) другого государства-члена в связи с работой по найму, осуществляемой в первом упомянутом государстве-члене, такой доход облагается в первом государстве-члене с первого дня работы по найму по налоговым ставкам, предусмотренным для таких доходов физических лиц - налоговых резидентов (лиц с постоянным местопребыванием) этого первого государства-члена.Положения данной статьи применяются к налогообложению доходов в связи с работой по найму, получаемых гражданами государств - членов Евразийского экономического союза.Таким образом, с учетом положений статьи 73 Договора и пункта 1 статьи 224 Кодексадоходы в связи с работой no найму, осуществляемой в Российской Федерации гражданами государств - членов Евразийского экономического союза, подлежат обложению налогом на доходы физических лиц с применением налоговой ставки 13 процентовначиная с первого дня их работы на территории Российской Федерации.При этом по итогам налогового периода определяетсяокончательный налоговый статус физического лица в зависимости от времени его нахождения в Российской Федерациив данном налоговом периоде.Изложенный порядок определения налогового статуса применяется в отношении физических лиц независимо от гражданства.Таким образом, если по итогам налогового периода сотрудник организации не приобрел статус налогового резидента (находился в Российской Федерации менее 183 дней), суммы налога, удержанного с его доходов, полученныхв данном налоговом периоде, подлежат перерасчету налоговым агентом по ставке в размере 30 процентов.
Цитата: Налоговым периодом признается календарный год.